Pathologies respiratoires
Test de première intention
Description du test :
Le test Xpert MTB/RIF est une avancée significative dans le diagnostic de la tuberculose, utilisant la PCR nichée en temps réel pour la détection de l’ADN complexe de Mycobacterium tuberculosis « bacille de Koch ». Il est également capable de détecter les mutations associées à la résistance à la rifampicine.
Conditions pré analytiques :
Divers types d’échantillons biologiques : Crachats, expectorations, liquides pleuraux, ascites, sang, ganglions, liquide céphalorachidien, selles ou urine. Un flacon stérile est nécessaire pour collecter l’échantillon, avec un volume minimum requis d’au moins 1,5 mL.
Conservation des échantillons :
3 jours à température ambiante.
4 et 10 jours à une température comprise entre +4°C et +8°C.
Performance Clinique :
Détection de M. tuberculosis : Sensibilité = 98% Spécificité = 98,3%
Résultats et Interprétation :
– Bacille de Koch DÉTECTÉ ; résistance à la rifampicine DÉTECTÉE : Cela signifie que la cible du bacille de Koch est présente dans l’échantillon, et qu’une mutation du gène rpoB a été détectée.
– Bacille de Koch DÉTECTÉ ; résistance à la rifampicine NON DÉTECTÉE : Dans ce cas, la cible du bacille de Koch est présente dans l’échantillon, mais aucune mutation du gène rpoB n’a été détectée, indiquant l’absence de résistance à la rifampicine.
– Bacille de Koch DÉTECTÉ ; résistance à la rifampicine INDÉTERMINÉE : Lorsque la cible du bacille de Koch est présente dans l’échantillon, mais que la résistance à la rifampicine ne peut pas être déterminée en raison d’une détection insuffisante du signal.
– Bacille de Koch NON DÉTECTÉ : Si la cible du bacille de Koch n’est pas détectée dans l’échantillon, cela indique une absence de Mycobacterium tuberculosis.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures
Tarif :
7500 DZD TTC
Test de deuxième intention
Description du test :
Test de deuxième intention pour la détection de la présence de Mycobacterium tuberculosis et de sa résistance à l’isoniazide, les fluoroquinolones, l’amikacine, la kanamycine, la capreomycine et l’ethionamide, sur échantillon respiratoire (GeneXpert®).
Conditions pré analytiques :
Divers types d’échantillons biologiques : Crachats, expectorations, liquides pleuraux, ascites, sang, ganglions, liquide céphalorachidien, selles ou urine. Un flacon stérile est nécessaire pour collecter l’échantillon, avec un volume minimum requis d’au moins 1,5 mL.
Conservation des échantillons :
3 jours à température ambiante.
4 et 10 jours à une température comprise entre +4°C et +8°C.
Résultat et interprétation :
– Positif ou négatif pour la présence de Mycobacterium tuberculosis complexe.
– En cas de présence d’ADN de Mycobacterium tuberculosis complexe, le résultat de la détection de mutations de résistance à l’isoniazide et aux antibiotiques de deuxième ligne est également fourni (Résistance détectée/ non-détectée).
Délai de rendu des résultats :
Contacter le laboratoire
Tarif :
20 000 DZD TTC.
Détection rapide du SARS-CoV-2, le virus responsable de la COVID-19, avec
trois cibles génétiques
Détection et différenciation rapides du SARS-CoV-2, du virus de la grippe A,
du virus de la grippe B et du VRS, avec l’ajout d’une 3e cible génétique pour
le SARS-CoV-2
Pathologies infectieuses
Le test HBV VL Assay quantifie les génotypes A-H du HBV sur la plage de 10 à 1 000 000 000 UI/mL (1 × 109 IU/mL). Le test HBV VL Assay est destiné à faciliter la prise en charge des patients infectés par le HBV qui sont sous traitement antiviral. Les résultats du test HBV VL Assay peuvent également être utilisés pour confirmer une infection à HBV.
Conditions pré analytiques :
Sang total sur 2 tubes EDTA, volume minimum de plasma EDTA requis : > 1,5 mL
Conservation :
24 heures sang total à T° ambiante
3 jours sang total entre +2 et +8°C
7 jours pour sérum entre +2 et +8°C
Caractéristiques des performances :
Limite de détection : 3,20 UI/mL
Seuil de quantification : 10 UI/mL
Spécificité de 100 %
Résultats et Interprétation :
– HBV Détecté à XX UI/mL (log X.XX) : Ce résultat signifie que l’ADN du HBV est détecté à une
concentration de XX UI/mL.
– HBV Détecté > 1 × 109 IU/mL : Si le résultat est supérieur à 1 × 109 IU/mL, cela indique que l’ADN du
– HBV est détecté au-dessus de la plage de mesure quantitative du test.
– HBV Détecté < 10 IU/mL : Un résultat inférieur à 10 IU/mL signifie que l’ADN du HBV est détecté, mais à une concentration en dessous de la plage de mesure quantitative du test.
– HBV Non Détecté : L’ADN du HBV n’a pas été détecté dans l’échantillon.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures
Tarif :
7000 DZD TTC.
Le test HCV VL Assay quantifie les génotypes 1 à 6 du HCV sur la plage de 10 à 100 000 000 UI/Ml (1 × 108
IU/mL). Le test HCV VL Assay est destiné à faciliter la prise en charge des patients infectés par le HCV qui sont
sous traitement antiviral.
Les résultats du test HCV VL Assay peuvent également être utilisés pour confirmer une infection à HCV.
Conditions pré analytiques :
Sang total sur 2 tubes EDTA, volume minimum de plasma EDTA requis : > 1,5 mL
Conservation :
6 heures sang total T° ambiante
3 jours sang total entre +2 et +8°C
7 jours pour plasma entre +2 et +8°C
Caractéristiques des performances :
Limite de détection : 4,0 UI/mL
Limite de quantification : 10 UI/mL
Spécificité de 100%
Résultats et Interprétation :
– HCV Détecté à XX UI/mL (log X.XX) : Ce résultat signifie que l’ARN du HCV est détecté à une
concentration de XX UI/mL, ce qui est crucial pour surveiller la charge virale chez les patients sous
traitement.
– HCV Détecté > 1 × 108 IU/mL : Si le résultat est supérieur à 1 × 108 IU/mL, cela indique que l’ARN du
– HCV est détecté au-dessus de la plage de mesure quantitative du test.
– HCV Détecté < 10 IU/mL : Un résultat inférieur à 10 IU/mL signifie que l’ARN du HCV est détecté, mais
à une concentration en dessous de la plage de mesure quantitative du test.
– HCV Non Détecté : Si le résultat est « HCV Non Détecté, » cela signifie que l’ARN du HCV n’a pas été
détecté dans l’échantillon.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures
Tarif :
7500 DZD TTC.
Détection et quantification du virus de l’immunodéficience humaine de type 1 (VIH-1)
Description du test :
Le test Xpert HIV-1 VL est un test in vitro de RT-PCR pour la détection et la quantification de l’ARN du Virus de l’immunodéficience Humaine de type 1 (VIH-1).
Ce test est conçu pour quantifier l’ARN du VIH-1 sur une plage étendue, allant de 40 à 10 000 000 copies/mL. Il est validé pour la quantification de l’ARN du VIH-1 du groupe M, englobant les sous-types (A, B, C, D, F, G, H, J, K, CRF01_AE, CRF02_AG et CRF03_AB), ainsi que des groupes N et O.
Types d’Échantillons :
Sang total sur 2 tubes EDTA, volume minimum de plasma EDTA requis : > 1,5 mL
Liquide céphalorachidien (LCR).
Conservation des Échantillons :
24 heures à température ambiante sang total EDTA.
3 jours sang total EDTA entre +2°C et +8°C.
6 jours (plasma après centrifugation) entre +2°C et +8°C.
6 semaines (plasma après centrifugation) à -20°C.
Caractéristiques des Performances :
Limite de détection ; 15,3 copies/mL.
Limite de quantification ; de 40 à 1 × 10⁷ copies/mL.
Résultats et Interprétation :
Les résultats du test Xpert HIV-1 VL sont interprétés de la manière suivante :
– HIV-1 DÉTECTÉ : L’ARN du VIH-1 est détecté à une concentration de XX copies/mL.
– HIV-1 DÉTECTÉ > 1 × 10⁷ copies/mL : L’ARN du VIH-1 est détecté au-dessus de la plage de mesure analytique (charge virale élevée).
– HIV-1 DÉTECTÉ < 40 copies/mL : L’ARN du VIH-1 est détecté en dessous de la plage de mesure
analytique (charge virale faible).
– HIV-1 NON DÉTECTÉ : L’ARN du VIH-1 n’est pas détecté.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures
Tarif :
7500 DZD TTC
Pathologies gynécologiques
Description du test :
Détection de la région E6/E7 du génome d’ADN viral issu du papillomavirus humain à haut risque (HPV) dans des échantillons patients. Le test effectue une amplification multiplex de l’ADN cible par une réaction en chaîne de la polymérase (PCR) en temps réel de 14 types de HPV en une seule analyse. Le test Xpert HPV identifie spécifiquement les types HPV 16 et HPV 18/45 dans deux canaux de détection distincts et signale 11 autres types à haut risque (31, 33, 35, 39, 51, 52, 56, 58, 59, 66 et 68) dans un résultat groupé.
Échantillons :
Échantillon cervical prélevé dans un flacon PreservCyt à l’aide d’un dispositif de type balai ou d’une brosse endocervicale associée à une spatule. Le Kit de prélèvement PreservCyt est fourni par le laboratoire.
Conservation :
Il est possible de conserver les échantillons cervicaux prélevés dans de la solution PreservCyt à T° ambiante jusqu’à six mois après la date de prélèvement.
Résultats et interprétation :
– HR HPV POS : L’ADN de HPV à haut risque est détecté positif.
– HR HPV POS : L’ADN de HPV à haut risque est détecté positif.
– HPV 16 POS : L’ADN du HPV 16 est détecté comme positif.
– HPV 18_45 POS : L’ADN du HPV 18_45 est détecté comme positif
– OTHER HR HPV POS : L’ADN d’autre HPV à haut risque est détecté comme positif.
– HR HPV NÉG(NON DETECTE) : L’ADN de HPV à haut risque est inférieur au niveau de détection.
– HPV 16 NÉG (NON DETECTE) : L’ADN du HPV 16 est inférieur au niveau de détection.
– HPV 18_45 NÉG (NON DETECTE) : L’ADN du HPV 18-45 est inférieur au niveau de détection.
– OTHER HR HPV NÉG(NON DETECTE) : L’ADN d’autre HPV à haut risque est inférieur au niveau de détection.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures
Tarif :
9 800 DZD TTC.
Description du test :
Chlamydia trachomatis (CT) est une bactérie Gram négative non mobile qui agit en tant que parasite intracellulaire obligatoire des cellules eucaryotes en raison de son incapacité à synthétiser de l’ATP. L’espèce CT comprend au moins quinze sérovars pathogènes chez l’homme. Les sérovars D à K sont la cause principale d’infections à Chlamydia de l’appareil uro-génital masculin et féminin. En l’absence de traitement, les infections à CT peuvent être à l’origine d’urétrites non gonococciques, d’épididymites, de proctites, de cervicites et de salpingites aiguës. Chez la femme, les infections à CT non traitées peuvent conduire à une
maladie inflammatoire pelvienne (MIP) chez plus de 40 % de la population infectée et à l’infertilité chez 20 % de ces patientes. La MIP peut se manifester sous la forme d’endométrites, de salpingites, de péritonites pelviennes et d’abcès tubo-ovariens.
Neisseria gonorrhoeae (NG) est une bactérie diplocoque Gram négative non mobile responsable d’infections gonococciques. Les infections gonococciques sont au deuxième rang des maladies sexuellement transmissibles (MST) à bactéries les plus fréquemment signalées. La majorité des infections urétrales masculines à NG provoquent des symptômes aboutissant à traitement curatif, mais chez la femme les symptômes peuvent être non reconnaissables jusqu’à la survenue de complications (p. ex. MIP).
Conditions pré analytiques :
– Écouvillonnages endocervicaux et écouvillonnages vaginaux : tubes SWAB fourni par le laboratoire.
– Échantillons d’urine de début de miction (premier jet urinaire) : flacon stérile
– Échantillons de perme : flacon stérile, acheminement rapide au laboratoire.
Résultats et interprétation :
– CT DETECTED (CT DÉTECTÉ) et NG DETECTED (NG DÉTECTÉ) : Les séquences ADN des cibles CT et NG ont été détectées.
– CT NOT DETECTED (CT NON DÉTECTÉ) et NG DETECTED (NG DÉTECTÉ) : La séquence ADN de la cible CT n’a pas été détectée ; les séquences ADN des cibles NG ont été détectées.
– CT DETECTED (CT DÉTECTÉ) et NG NOT DETECTED (NG NON DÉTECTÉ) : La séquence ADN de la cible CT a été détectée ; les séquences ADN des cibles NG n’ont pas été détectées.
– CT NOT DETECTED (CT NON DÉTECTÉ) et NG NOT DETECTED (NG NON DÉTECTÉ) : Ni la séquence ADN de la cible CT, ni les séquences ADN des cibles NG n’ont été détectées.
– INVALID (ININTERPRETABLE) : Résultat non concluant : Interférence liée à la présence probable d’un inhibiteur de PCR dans le prélèvement.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures.
Tarif :
7 500 DZD TTC
Description du test :
Détection par PCR de Trichomonas vaginalis dans les échantillons masculins et féminins
L’identification des infections à Trichomonas vaginalis (TV) est problématique. La nature exigeante de cet organisme fragile en dehors de ses conditions de vie optimales, ainsi que la sensibilité limitée de la microscopie en montage humide et les délais pour obtenir un diagnostic concluant à partir des méthodes de culture, rendent difficile la détection de cette infection asymptomatique. Les symptômes seuls sont insuffisants pour diagnostiquer une infection à TV. Chez les femmes, les caractéristiques de l’écoulement vaginal, la couleur et l’odeur, sont de mauvais prédicteurs de cette infection généralement asymptomatique.
Conditions pré analytiques :
– Écouvillonnages endocervicaux et écouvillonnages vaginaux : tubes SWAB fourni par le laboratoire.
– Échantillons d’urine de début de miction (premier jet urinaire) : flacon stérile
– Échantillons de perme : flacon stérile, acheminement rapide au laboratoire.
Délai de rendu des résultats : contacter le laboratoire
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures.
Tarif :
5 000 DZD TTC
Détection de l’ADN du M. genitalium + la résistance aux macrolides
Description du test :
infection sexuellement transmissible (IST) à M. genitalium est traitée selon une approche syndromique, et ses signes cliniques sont similaires à ceux de l’infection à Chlamydia trachomatis. La prévalence des infections à M. genitalium dans la population générale varie de 1 à 4 % et leur traitement s’avère difficile en raison des taux élevés de résistance aux macrolides.
Le test de résistance aux macrolides est préconisé par les recommandations internationales et locales pour la prise en charge des infections à M. genitalium. Le test de la résistance aux macrolides peut orienter le choix d’un traitement approprié et permettre un traitement basé sur la résistance.
Le traitement basé sur la résistance a fait ses preuves sur le plan clinique en améliorant le taux de guérison des patients et leur prise en charge globale.
La détection rapide de la résistance aux macrolides permet de réduire le temps de guérison, tout en évitant la transmission.
Conditions pré analytiques :
– Écouvillonnages endocervicaux et écouvillonnages vaginaux : tubes SWAB fourni par le laboratoire.
– Échantillons d’urine de début de miction (premier jet urinaire) : flacon stérile
– Échantillons de perme : flacon stérile, acheminement rapide au laboratoire.
Délai de rendu des résultats : contacter le laboratoire
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures.
Tarif :
5 000 DZD TTC
Oncologie et génétique humaine
Description du test :
L’utilité clinique d’une surveillance des taux d’ARNm BCR-ABL par RT-PCR a été établie dans l’étude randomisée internationale de l’interféron et de STI571 (IRIS, International Randomized Study of Interferon and STI571), dans laquelle les résultats des patients ont été standardisés en utilisant une ligne de base normalisée commune aux trois laboratoires participant à l’essai.4 Par la suite, on a proposé que les tests de surveillance du BCR-ABL se conforment à une échelle internationale (International Scale, IS) et qu’ils soient liés à deux valeurs définies dans l’essai IRIS, permettant ainsi aux résultats d’être exprimés sur une échelle commune. La première de ces valeurs est la ligne de base normalisée qui représente IS 100 % et la deuxième est une réduction log 3 par rapport à la ligne de base normalisée, à pronostic favorable, qui représente IS 0,10 % (également appelé réponse moléculaire majeure [RMM]).5 Les tests moléculaires normalisés IS peuvent fournir une aide essentielle aux cliniciens dans la prise en charge des patients atteints de LMC.
Le test Xpert BCR-ABL Ultra quantifie le taux d’ARNm BCR-ABL sur l’IS grâce à l’étalonnage du test par rapport au premier panel de référence génétique international de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) destiné à la quantification de l’ARNm BCR-ABL. Conformément au protocole recommandé, Cepheid a mis au point et validé des étalons quantitatifs secondaires qui sont alignés avec le panel de référence primaire de l’OMS. Ceci permet de déterminer un facteur de conversion d’IS spécifique au lot pour chaque lot de kits Xpert BCR-ABL Ultra. L’efficacité de l’étalonnage par rapport aux étalons secondaires est surveillée de façon continue.
Conditions pré analytiques :
Sang total sur 2 tubes EDTA, volume minimum requis : > 2 mL.
Conservation :
24 heures à T° ambiante
3 jours sang total EDTA et 7 jours pour sérum EDTA entre +2 et +8°C
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures.
Tarif :
29 000 DZD TTC
Suivi des patients atteints de cancer de la vessie non invasif sur le plan musculaire (CVNIM) avec une surveillance non invasive (utilisant de l’urine mictionnelle).
Description du test :
Xpert® Bladder Cancer Monitor est un test non invasif de détection de biomarqueurs, destiné à surveiller la récidive des patients atteints de cancer de la vessie non invasif sur le plan musculaire CVNIM en conjonction avec d’autres mesures cliniques. Après analyse de centaines de marqueurs tumoraux connus, les cinq meilleurs ARNm indicateurs du cancer de la vessie ont été identifiés et sélectionnés. Utilisant de l’urine mictionnelle, le test est facile à réaliser en 90 minutes et utilise des cartouches closes et un système automatisé. Le test a été développé pour avoir une sensibilité et une valeur prédictive négative élevées, en particulier pour les tumeurs agressives de haut grade. Chaque cartouche contient trois contrôles pour des résultats fiables.
Conditions pré analytiques :
Échantillons d’urine de début de miction flacon stérile, acheminement rapide au laboratoire.
Présentation obligatoire d’un rapport médical détaillé.
Compte rendu histopathologique requis.
Conservation :
Les échantillons sont stables jusqu’à 7 jours dans les tubes de réactif de transport d’urine Xpert® entre 2 et 28 °C
Délai de rendu des résultats :
Veuillez contacter le laboratoire.
Tarif :
Devis disponible sur demande et ajusté en fonction des exigences spécifiques. Possibilité d’établir une convention tarifaire.
Mesure semi-quantitative des biomarqueurs d’ARNm ESR1, PGR, ERBB2 et MKi67 dans du tissu de cancer invasif du sein fixé au formol et inclus en paraffine (FFPE)
Description du test :
Les résultats des biomarqueurs ER/PGR/HER2/Ki-67 du cancer du sein doivent être fiables et objectifs. Les cliniciens ont besoin d’une évaluation plus fiable des biomarqueurs ER/PGR/HER2/Ki-67 dans les tissus tumoraux FFPE. 5 % des résultats HER2 par IHC sont équivoques d’après les classements recommandés par les directives. La résolution des résultats HER2 IHC2+ équivoques par test FISH représente un défi. La variabilité entre les techniques et les observateurs peut conduire à environ 20 % de résultats ER et PGR erronés.
Les scores Ki-67 IHC présentent un écart en raison du manque de normalisation.
Conditions pré analytiques :
Échantillons de tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE).
Présentation obligatoire d’un rapport médical détaillé.
Compte rendu histopathologique requis.
Délai de rendu des résultats :
Veuillez contacter le laboratoire.
Tarif :
Devis disponible sur demande et ajusté en fonction des exigences spécifiques. Possibilité d’établir une convention tarifaire.
Mutations des facteurs II (G20210A) et V Leiden (G1691A)
Description du test :
La mutation du Facteur II ou Prothrombine (G20210A) se traduit par le changement de G en A sur le nucléotide 20210 dans la région 3’ non traduite du gène et est associée a une élévation du taux plasmatique de prothrombine. La mutation du Facteur V Leiden (G1691A) se traduit par le changement de G en A sur le nucléotide en position 1691 du gène du Facteur V, résultant en une substitution de l’acide amine Arginine par la Glutamine dans la protéine Facteur V,
entrainant une résistance au clivage par la Protéine C Activée (PCA).
Les mutations des facteurs II (G20210A) et V Leiden (G1691A) sont présentes dans 2% et 5% de la population générale.
Conditions pré analytiques :
Sang total sur 2 tubes EDTA, volume minimum requis : > 2 mL.
Conservation :
24 heures à T° ambiante
3 jours sang total et 7 jours pour sérum EDTA entre +2 et +8°C
Résultats et interprétation :
– FII NORMAL : mutation du Facteur II ou Prothrombine (G20210A) non détectée.
– FV NORMAL : mutation du Facteur V Leiden (G1691A) non détectée.
– FII HETEROZYGOUS : mutation du Facteur II ou Prothrombine (G20210A) détectée à l’état
hétérozygote.
– FV HETEROZYGOUS : mutation du Facteur V Leiden (G1691A) détectée à l’état hétérozygote.
– FII HOMOZYGOUS : mutation du Facteur II ou Prothrombine (G20210A) détectée à l’état homozygote.
– FV HOMOZYGOUS : mutation du Facteur V Leiden (G1691A) détectée à l’état homozygote.
Délai de rendu des résultats :
Maximum 48 heures.
Tarif :
7 000 DZD TTC
Description du test :
La Janus kinase 2 (JAK2) est une protéine de type tyrosine kinase impliquée dans plusieurs voies de signalisation responsables principalement de la survie et de la prolifération cellulaire. La mutation JAK2 V617F associée aux syndromes myéloprolifératifs (néoplasies myéloprolifératives) a été décrite comme un événement génétique fréquent chez la majorité des patients atteints de la polyglobulie de Vaquez (90%), de la thrombocytémie essentielle (50%) et de la myélofibrose idiopathique (50%). Cette mutation est caractérisée par un changement d’un nucléotide (un T pour un G) sur l’exon 14 du gène JAK2 situé sur le chromosome 9, locus 9p24.1, conduisant à une substitution de la valine en phénylalanine en position d’acide aminé 617 de la protéine JAK2.
Conditions pré analytiques :
Sang total sur 2 tubes EDTA, volume minimum requis : > 2 mL.
Conservation :
24 heures à T° ambiante
3 jours sang total et 7 jours pour sérum EDTA entre +2 et +8°C
Délai de rendu des résultats :
Contacter le laboratoire
Tarif :
20 000 DZD TTC